生物肥料在中國生產，經歷了幾起幾落的發展過程，但從總體速度來看是較慢的。20世紀50年代大力推廣應用大豆、綠肥根際固氮菌。當時全國各地差不多每個縣都有菌肥廠。這個時期的生物肥料生產只求產量，不顧及質量，持續時間很短。

　　生物肥料

　　20世紀60年代末至七十年代初，全中國許多地方又恢復生物肥料生產和推廣細菌肥料，大部分采用發酵生產。與20世紀50年代相比，質量有了提高，但后來許多地方用爐灰渣替代草炭作吸附劑，產品質量下降，農民就不愿意使用了。這兩個階段的生物肥料生產有一個共同點——產品沒有嚴格的質量監督管理。20世紀80年代初，中國生物肥料生產及應用由于其增產明顯，品質改善、特別是對環保的特殊作用，又呈上升趨勢，開始出現了固氮、解磷和解鉀生物肥料極其由此演變出來的各種名稱各異，千奇百態的生物肥料。

　　還不斷有新的企業投入生產，有新的產品出現。國外生物肥料生產技術和產品也開始擁入中國市場，中國生物肥料的生產又進入了一個新的發展時期。問題

　　1、生物肥料生產企業發展過快過多，但多數是小規模企業，作坊式生產，設備工藝落后，職工素質不高，因此生物肥料產品質量參差不齊，產品中的成分構成不科學。

　　2、生物肥料種類很多，但多數還是傳統的固氮、解磷、解鉀細菌，有的甚至還在用酵母菌，缺乏新型產品。菌株目標效能不穩定，配方不盡合理、抗逆性差。生物肥料本身的基礎研究和應用研究還不夠，科研人員相對不足。有些作用機理還不清楚，對土壤和作物的影響還有待于繼續研究?；A研究嚴重滯后于生產實際，生物肥料的推廣未能遵從試驗、示范、推廣的程序。

　　3、市場監督管理缺乏必要的條件，少數企業在宣傳上夸大使用效果，使用不正當經營手段，甚至生產假冒偽劣產品，給農民造成損失，降低了生物肥料的聲。管理不夠規范，國家雖然實行了登記證管理制度，但管理力度不夠，不少未登記的企業或產品甚至假冒劣產品還在大張旗鼓的宣傳，生產和銷售，片面夸大生物肥料的作用，把生物肥料當作是能醫治百病的“神仙水”。

　　4、對生物肥料的正確宣傳和引導還不夠，其好處和效果還沒有為廣大農民所接受，生物肥料在全中國肥料中所占的比重還不大。

　　5、生物肥料試驗設計的不合理、不科學，帶來試驗結果的不真實。檢測標準不科學，帶來了產品質量的不穩定和不真實。